Výkonnostní techniky pro sestavování a anotaci bakteriálního genomu využívající číslicové zpracování genomických signálů
Výzkumná skupina: Číslicové zpracování genomických signálů
Začátek projektu: 2017
Konec projektu: 2019
Poskytovatel: GAČR
Cílem projektu je návrh nových výpočetních metod pro sestavování bakteriálních genomů a jejich anotaci pomocí signálového zpracování genomických signálů a metod strojového učení. Tyto metody povedou ke zpřístupnění celogenomových analýz umožňujících přesnější popis přenosu antibiotické rezistence. Vývoj výpočetních metod je laboratorně testován na bakteriích Klebsiella pneumoniae a Clostridium difficile ve spolupráci s laboratoří molekulární biologie FN Brno.